申請人在獲得經認可的認證機構頒發的認證證書后可以在非零售產品包裝、產品宣傳材料、商務活動中使用認證標志（果蔬類認證產品可以在零售包裝上使用認證標志）。認證標志使用時可以等比例放大或縮小，但不允許變形變色；在使用認證標志時，必須在認證標志下標注注冊號。證書持有人應對認證證書和認證標志的使用和展示進行適當的控制；一旦發現錯誤的宣傳和使用，認證機構有權采取適當的措施進行處置。認證機構對認證證書持有人和農業生產經營者組織對其成員的制裁方式有：告誡、暫停和撤銷。